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Responsable administrative et financière.
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Personnels techniques
Responsable technique plateau AE. Analyses CN, ions (NO3/NH4/TDN/Cl/Ca/SO4)
Mon travail au LECA consiste à maintenir le package R biomod2 conçu par l’équipe. Il s’agit d’un package pour créer des modèles de distribution d’espèces. Je veille au bon fonctionnement de cette plateforme et implémente de nouvelles options.
I’m interested in developing and applying bioinformatics tools to analyze data produced by high-throughput techniques to address questions in ecology, evolution, biodiversity, systematics and population genomics.
Mon travail au LECA consiste à apporter mon expertise sur les systèmes de calcul à haute performance. J’assiste les utilisateurs dans la mise au point de leurs travaux de calcul tels que des simulations, des analyses ou des traitements massifs de données. J’assure le lien technique avec le service de calcul et de stockage intensifs de l’université (GRICAD) au sein duquel je travaille également une partie de mon temps.
I am a bioinformatic engineer working on metabarcoding pipeline and its improvement to analyze sequencing data from environmental DNA.
I am an ingenieer specialised in molecular biology. I have to develop and apply techniques involved in extraction, dosing and analyses of nucleic acids. I am developping qPCR tests to detect aquatique species (fish, algae, insect larvae) in sediments of alpin lacks in collaboration with CARRTEL. I am developing a qPCR test to detect five ungulates species simultaneously on conifers twigs in collaboration with ONCFS. I am also involved in genotyping projects in chamois and orthoptera.
I am currently working on soil microbial communities as a research engineer.My aim is to characterize the functional and taxonomic composition of these communities by using metagenomic data.Also, I am interested in linking traits and functional diversity with environmental conditions.
Je suis en charge de la gestion des insectariums du LECA (responsable technique, gestion, coordination des expérimentations). Spécialiste de l’élevage des moustiques du genre Aedes.Mes activités de recherche sont liées aux études de la résistance des moustiques aux insecticides.Je contribue à l’activité d’un plateau technique "Méthodes Moléculaires et Biochimiques appliquées à l’écologie" (MEMOBIO). Extractions ADN/ARN analyses qPCR, ddPCR.Je participe en enseignement pour des TP d’écologie de terrain (description des écosystèmes, inventaires faune et flore, etc.)
Utilisation des marqueurs moléculaires (séquençage, AFLP, PCR-RFLP, SNP, SSCP, DNA barcoding) et du metabarcoding sur ADN moderne (patrons de biodiversité, régimes alimentaires, etc) et ADN ancien (paléoenvironnement, agropastoralisme, etc).Spécialisé dans la production de masse de donnée de séquençage nouvelle génération par metabarcoding d’ADN environnemental à partir de différent milieux (contenus stomacaux, feces, eau, sols, sédiments, neige, dépôts de tsunamis).Responsable de la partie moléculaire du plateau EET.Expertise dans la projection hors laboratoire des moyens techniques de paillasse.Responsable des activités terrain moyenne montagne.
My current position involves Investigating the utility of plant traits (physical or physiological attributes of plants) as tools to predict the impacts of land use change, climate change, plant invasions or other environmental changes on the functioning of ecosystems (e.g. their nutrient cycling, productivity, invasion resistance etc.) and the services they provide. I am also involved in applied and fundamental research concerning the operationalisation, quantification, and mapping of ecosystem services and identifying and analysing the resulting trade-offs and synergies among multiple ecosystem services that can provide a basis for land management decisions.
Je travaille avec les données de biodiversité obtenues via nos partenaires (parcs, conservatoires...) ou nos campagnes de terrain. Je réalise des modèles de distribution d’espèces (SDM) et de végétation (FATE). Je participe à la formation au sein du LECA, que ce soit pour l’analyse de données (scripts, langage R...) ou l’utilisation de ressources de calcul (GRICAD - Ciment).
Je suis en charge des analyses physico-chimiques environnementales pour les laboratoires LECA et CARRTEL. Mes principales missions sont la gestion analytique, technique, organisationnelle et scientifique pour les activités de recherche dans les domaines de la biogéochimie et de l’environnement. Les analyses sont assez variées (phénols, phosphores ammonium, CO2, N2O, CH4) sur différentes matrices comme l’eau, les sols, les sédiments, les plantes...
Spécialisé dans le domaine de la biologie moléculaire, je développe et utilise des techniques d’extraction, dosage, et analyse des acides nucléiques (ADN et ARN) dont notamment l’analyse par QPCR et ddPCR des échantillons environnementaux.
En tant qu’ingénieur de recherche en intelligence artificielle, je coordonne un projet qui rassemble des spécialistes du séquençage de nouvelle génération, des chercheurs en écologie quantitative et des experts en intelligence artificielle, dont l’objectif est de développer une approche innovante pour le suivi de l’état et de l’évolution de la biodiversité et de la fonctionnalité des écosystèmes à l’échelle du globe.
I’m a bioinformatician with expertise in developing molecular phylogeny software. I’m also interested in software interoperability. I bring my skills to biodiversity studies.
En charge de l’élaboration et de la réalisation des campagnes de terrain de l’observatoire de Biodiversité de long-terme ORCHAMP, j’en co-anime le réseau composé d’acteurs académiques et non académiques répartis sur l’ensemble des Alpes Françaises et des Pyrénées. Je réalise également une partie de l’analyse des échantillons de sol en laboratoire et je participe a la valorisation des données issues des suivis des différents compartiments de l’écosystème.
With a background in mathematics and computer science, I bring my machine learning skills to community ecology projects.
Je m’occupe de coordonner les activités du living lab VIVALP à l’échelle de ses trois territoires : 3 Vallées, Pays de la Meije et Champsaur. Ce living lab s’inscrit dans le projet national de recherche SOLU-BIOD qui vise à identifier les SfN existantes dans différents territoires, en expérimenter de nouvelles et les disséminer, le tout en co-construisant avec les acteurs locaux les enjeux et le déroulement du projet.
I am currently a research engineer in charge of the ANAEE eDNA platform. My work consists in proposing an environmental metabarcoding service to people who want to study plant, animal and microbial communities from environmental samples (water, sediments, faeces etc.).My activities include the entire experiment process from the molecular processing (extraction, PCR, library preparation) to in silico analyses of metabarcoding data (data cleaning, taxonomic assignation).Otherwise, my research interest is focused on the use of environmental metabarcoding tools to address ecological issues, especially emerging diseases.
Mon travail gravite autour des différents outils de la géomatique. Cela va de l’administration, l’acquisition et l’analyse de données spatiales jusqu’à la production cartographique. Il consiste également à assister les chercheurs du laboratoire dans la conception et l’administration de base de données ainsi que dans le développement des interfaces de saisies en ligne (Applications web) ou embarquées (Carnet de terrain électronique) qui permettent d’alimenter ces bases. Je participe également aux campagnes de terrain sur des aspects botaniques (relevés flore, points contact, mesures de traits fonctionnels...).
Responsable technique de la partie EM du plateau AEEM. Développement, adaptation et optimisation de marqueurs moléculaires (ddRAD, AFLP) et de méthodes moléculaires (barcoding, metabarcoding). Expertise dans la conduite de techniques de biologie moléculaire : de l’extraction de l’ADN, dégradé ou en faible quantité (échantillons de sols, ...), jusqu’à la production du génotype (séquence d’ADN). Experte dans la production de données haut-débit.
En charge de l’élaboration et de la réalisation de campagnes de terrain pour des projets d’observations et d’expérimentations à long terme du LECA, je suis coordinatrice de l’observatoire ORCHAMP pour lequel j’anime le réseau des acteurs académiques et non académiques répartis sur l’ensemble des Alpes Françaises.
Je suis assistante ingénieur en biologie moléculaire. Mon travail consiste à effectuer des extractions d’ADN, faire le dosage de ces échantillons et assister les ingénieurs et chercheurs lors de la mise au point de protocoles de PCR et qPCR pour les réaliser ensuite en routine au laboratoire. Je réalise également des préparations de librairies de gènes pour du séquence NGS sur des échantillons d’ADN environnemental (sédiments de lacs).
Responsable scientifique du plateau technique EXAM : Expérimentation AmphibienMembre de la Structure Bien Etre Animal (SBEA) de l’UFR Chimie-BiologieResponsable de la microscopieMes activités :- Développement technique en biologie cellulaire, moléculaire (histologie, biochimie, extraction ADN et ARN sur tissus)- Analyse de données RNAseq (galaxy)- Gestion, organisation, réglementation et législation de l’expérimentation chez les amphibiensDoctorante EDCSV : spécialité Biodiversité-Ecologie-EnvironnementSujet : Effets directs et transgénérationnels d’un perturbateur endocrinien le benzo[a]pyrène et d’un perturbateur endocrinien potentiel le triclosan seuls ou en mélange chez les mâles d’une espèce modèle d’amphibien (Xenopus tropicalis).