MEMOBIO

Méthodes Moléculaires et Biochimiques appliquées à l’Écologie

Responsable scientifique : Jean-Philippe DAVID
Expertise technique : Thierry GAUDE, Frédéric LAPORTE, Sophie PERIGON

Ce plateau technique réalise des analyses sur différents supports biologiques (acides nucléiques, protéines et molécules) appliquées à l’écologie. Les modèles biologiques sont des organismes isolés (plantes, animaux, champignons, bactéries) prélevés sur le terrain ou cultivables en laboratoire.

Les analyses effectuées incluent des analyses moléculaires ciblées sur gènes, ADN et ARN (extraction, purification et dosage des acides nucléiques, PCR, qPCR, RT-qPCR, Clonage, séquençage, …) et analyses protéiques (extraction, purification et dosage, séparation/chromatographie, blots et enzymologie, spectrographie, …).

Le plateau MEMOBIO permet aussi d’effectuer des analyses chimiques sur des molécules naturelles ou d’origines anthropiques et de leurs métabolites dans les différents compartiments de l’écosystème et du vivant (chimie extractive et analytique).

Principales compétences et techniques

Biologie Moléculaire :

Extraction acides nucléiques (ADN, ARN) et dosage en plaque 96 puits
Amplification d’ADN par PCR, transcription reverse, digestions enzymatiques
Quantification ADN/ ARN et génotypage par PCR quantitative en temps réel (96 et 384 puits)
Séquençage Sanger et analyse de séquence

Biochimie :

Extraction et purification et dosage de protéines et analyse par électrophorèse et chromatographie
Enzymologie par spectrographie (UV/Vis) et analyse de fluorescence et luminométrie
Extraction/séparation de composés organiques

Fonctionnement

Le plateau technique MEMOBIO est composé de 4 laboratoires d’une superficie totale de 144 m2 réparties au sein du LECA. Il propose différents modules d’analyse spécifiques et fournit aux utilisateurs les produits chimiques et consommables d’usage courant. Avant toute utilisation du plateau technique, une fiche projet doit être établie, le règlement intérieur et la charte d’utilisation du plateau signés. Les utilisateurs sont aussi incités à assister aux réunions techniques mensuelles permettant de planifier l’utilisation des appareils, de demander de l’aide technique et d’échanger sur les développements techniques réalisés au sein du plateau.

La tarification (académique interne, académique externe ou extérieurs) est indiquée sur la charte et la facturation est réalisée pour moitié en début puis ajustée en fin de projet.

Principaux équipements

– Biorad CFX96 et CFX384 Real Time PCR systems
– Biorad IQ5 Multicolor Real Time PCR System
– Hotte à flux laminaire MSC II
– Nanodrop Spectrophotometer ND-1000
– Qubit quantififcation system (tube ou 96 puits)
– Thermocycleur à gradient
– Lecteur de microplaque multifonctions Thermo
– Varioskan Flash (UV/Visible/Fluo/lumino)
– Spectrophotomètre bi-faisceaux de haute qualité
– Rotavapor (extraction organique)
– Congélateur -20°C et -80°C (stockage)
– Cuves pour électrophorèses