Logiciels


ADN metabarcoding

Outils pour l’analyse de données issues du séquençage ADN :
 OBITools
 ecoPrimers, ecoPCR
 sumaclust, sumatra

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Génomique des populations

 ABC4F : Approximate Bayesian Computation for F-statistics
 BayeScan : BAYEsian genome SCAN for outliers
 BIMr : Bayesian Inference of imMigration rates
 COLONISE
 GENBMAPis
 GESTE : GEnetic STructure inference based on genetic and Environmental data
 ISIF : In SIlico Fingerprinting
 PARENTE
 ScanAFLP
 WOMBSOFTis

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Packages R

 BBMV : phylogenetic comparative methods
 biomod2 : ensemble platform for Species Distribution Modeling
 TheiaR : interface to download and manipulate data from Theia

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